A estrutura organizacional do Instituto é formada por um colégio de associados, os conselhos estratégico, fiscal e comunitário além da diretoria executiva. Na estrutura da diretoria estão alocados os cargos de administração que atuam nos planos tático e operacional da instituição.

Esses órgãos têm como finalidade garantir uma administração eficiente com foco na qualidade dos serviços oferecidos, com padrões de controle e transparência e, principalmente, voltado para uma visão estratégica de futuro orientada pelos integrantes dos conselhos e diretoria executiva.